ezRun:用于分析下一代测序数据的 R 元包-源码
易润
用于分析下一代测序数据的 R 元包。
ezRun包的版本绑定了 Bioconductor 开发分支的发布。
Python 包的依赖关系
pip3 install velocyto magic - impute
pip3 install multiqc
R/Bioconductor 包的依赖关系
packages <- c( " testthat " , " knitr " , " goseq " , " ChIPpeakAnno " ,
" DESeq2 " , " TEQC " , " pathview " , " reshape2 " ,
" vsn " , " Rsubread " , " preprocessCore " , " wesanderson " ,
" RCurl " ,
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[{"title":"（ 719 个子文件 124.69MB ） ezRun:用于分析下一代测序数据的 R 元包-源码","children":[{"title":".gitignore <span style='color:#111;'> 97B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"NAMESPACE <span style='color:#111;'> 327B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"RnaSeqWithAdditionalSpecies.Rmd <span style='color:#111;'> 3.45KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"ReferenceGenomeFolders.Rmd <span style='color:#111;'> 7.24KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"00readme.txt <span style='color:#111;'> 506B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"......","children":null,"spread":false},{"title":"<span style='color:steelblue;'>文件过多，未全部展示</span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}]
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