Genome Microsatellite Analyzing Tool:GMATO：适用于任何大小的巨大基因组的微卫星分析工具-开源

越来越多的巨大全基因组 (>1G) 的序列可用性不断增加，击败了当前现有的 SSR 分析工具。 Genome-wide Microsatellite Analyzing Tool (GMATo) 是一个新的强大的程序，用于更快地挖掘任何长度、任何大小的 SSR，以及基因组方面的全面统计分析，专为基于 Perl 脚本的巨大基因组而设计。 只需要一个输入文件，其中包含原始 fasta 格式的 DNA 序列和表格格式的输出文件，列出所有 SSR 位点信息和四个生物学家感兴趣的分类的统计分布。 GMATo 还具有 Java 脚本的简单图形用户界面和 Perl 的命令行界面，可在 Windows、Linux 和 Mac 等平台上运行，为生物学家和生物信息学家提供易于定制的参数控制。 软件 GMATo 是在巨大基因组中进行 SSR 表征的更好工具 引用本文：Wang X. et al , Bioinformation [2013, 9(10):541-544]