est-sfs:估计展开的站点频谱和祖先状态-开源

上传者: 42165583 | 上传时间: 2022-06-08 16:10:12 | 文件大小: 194KB | 文件类型: GZ
est-sfs 使用最大似然方法来推断未折叠位点频谱 (uSFS) 和 DNA 序列数据的祖先状态概率。 uSFS 是对来自群体的基因拷贝样本中具有 x 衍生等位基因拷贝的核苷酸位点计数的载体。 est-sfs 使用来自多达三个外群物种的信息推断焦点物种多态位点的 uSFS 和祖先状态概率。 已经实施了三种核苷酸替代模型。 有关该方法的详细信息,请参见 Keightley 和 Jackson,Genetics 209:897-906 (2018)。

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