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上传时间: 2022-02-14 09:36:08
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文件大小: 22KB
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文件类型: -
转座子注释者“ reasonaTE”
转座子注释工具,用于注释转座子,转座子特征蛋白和转座子的结构元件。 原因是一部分。
输入:基因组程序集(FASTA文件)。
输出:很多转座子注释(GFF3文件)。
安装
作为安装:
conda install -c derkevinriehl transposon_annotator_reasonate
注意:否则,您可以在此Github存储库中找到所有源代码。
如何使用''reasonaTE''
步骤1)建立专案
mkdir workspace
reasonaTE -mode createProject -projectFolder workspace -projectName testProject -inputFasta sequence.fasta
步骤2)用注释工具注释基因组为了使用不同的注释工具注释基因组,存在三种可能的方法。