seqtk:用于处理FASTAQ格式的序列的工具包-源码

介绍 Seqtk是一种快速轻巧的工具，用于处理FASTA或FASTQ格式的序列。 它可以无缝解析FASTA和FASTQ文件，也可以选择使用gzip对其进行压缩。 要安装seqtk ， git clone https://github.com/lh3/seqtk.git ; cd seqtk ; make 唯一的库依赖项是zlib。 Seqtk示例 将FASTQ转换为FASTA： seqtk seq -a in.fq.gz > out.fa 将ILLUMINA 1.3+ FASTQ转换为FASTA并将质量低于20的碱基蒙版转换为小写字母（第一个命令行）或N （第二个）： seqtk seq -aQ64 -q20 in.fq > out.fa seqtk seq -aQ64 -q20 -n N in.fq > out.fa 折叠长的FASTA / Q线并删除FASTA / Q注