RSoptSC：scRNA-seq数据的细胞间通信和谱系推断-源码
RSoptSC
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SoptSC也可作为一个MATLAB包
安装
install.packages( " devtools " )
library( devtools )
install_github( " mkarikom/RSoptSC " )
特征
单个单元之间的单元间通信的推断
在统一的数学框架中整合多种分析：聚类，标记基因，伪时间和谱系推断
单元间相似度矩阵构建可改善聚类
基于NMF的标记基因鉴定
预测存在的簇数（通过相似性矩阵的eigengap属性）
伪时间中初始单元的预测
文献资料
提供了RSoptSC的完整详细信息和示例。
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