TMH_insertion_energy:推断 TMH 插入能量-源码
TMH_insertion_energy
从具有已知螺旋位置的参考序列推断 TMH 插入能量
数据
文件夹/文件
描述
reference_sequences
参考序列和相应的 HHM-profiles
sequences
fasta 格式的序列
profiles
使用 hhblits 针对 UniRef30 数据库创建的 HHM 配置文件
hhalign_X
每个轮廓与参考轮廓 X 的 HMM-HMM 对齐
dgpred_results
推断的螺旋和相应的 dgpred 能量计算
sequences.fasta
一个 fasta 文件中的所有序列
TMH_insertion_energies.xlsx
19 个残基窗口和全长螺旋的能量值和序列
脚本
python3 脚本fasta_to_helices.py将 fasta 格式的序列列表、相应的 HMM-profiles
文件下载
资源详情
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