workflow4metabolomics:Workflow4Metabolomics元存储库-源码

上传者: 42134143 | 上传时间: 2021-11-17 16:03:40 | 文件大小: 12.34MB | 文件类型: -
我们的项目 简称W4M的是法国的基础架构,提供软件工具处理,分析和注释代谢组学数据的功能。 它基于Galaxy平台。 在代谢组学()和生物信息学平台( )之间的协作中,我们已经使用Galaxy框架开发了完整的LC / MS,GC / MS和NMR管道,用于数据分析,包括预处理,标准化,质量控制,统计分析和注释步骤。 这些模块化和可扩展的工作流程由现有的组件(XCMS和CAMERA软件包等)组成,还包括一整套互补的自制工具。 可通过Web界面访问此实现,以确保参数的完整性。 Galaxy的高级功能使来自不同来源和不同类型的组件的集成成为可能。 因此,为代谢组学界(平台,最终用户等)提供了可扩展的虚拟研究环境(VRE),使新用户以及本领域专家可以共享预配置的工作流程。 引文 Giacomoni F.,LeCorguilléG.,Monsoor M.,Landi M.,Pericard P.,

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