GSPLS:小样本的多组学数据中基因型与表型的联系

上传者: 42133918 | 上传时间: 2022-05-05 01:20:41 | 文件大小: 5KB | 文件类型: ZIP
R
GSPLS 小样本的多组学数据中基因型与表型的联系 我的代码由六个R文件组成,每个文件的代码功能如下:1.GeneAnalysis.R 基因数据预处理,将Affymetric探针名称转换为Gene Symbol,如果存在相同的基因名称,则取基因表达的平均值。 2.SNPDataAnalysis.R SNP数据预处理,遗漏值不超过10%,且最频繁的数据应小于10%,然后过滤等位基因频率<0> 0.2)。 基因-基因网络通过SPICI聚类算法( )进行聚类 4.group-spls.R由于基因数量众多,因此获得

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