pyEntrezId:将Ensembl,Uniprot和HGNC ID转换为Entrez基因ID-源码

上传者: 42133329 | 上传时间: 2021-11-23 12:27:13 | 文件大小: 11KB | 文件类型: -
PyEntrezId Python软件包可在各种基因或蛋白质ID之间进行转换 概括 这是我发布的第一个程序包。 任何反馈将不胜感激! 我希望该项目可以作为初学者的示例,说明如何构造/编码简单的生物信息学工具。 我创建此程序包的原因是,我需要一个简单的工具来在用于标识基因,蛋白质等的多个ID之间进行转换。这之所以重要,是因为各种科研机构(NIH,EMBL等)托管的数据库有时具有不同的命名法描述相同的事物(基因,蛋白质,DNA,RNA等)。 讨论链接 Reddit:< > 快速开始 $ pip install --upgrade pyEntrezId 例子 将Ensemble转录本基因ID转换为Entrez基因ID from PyEntrezId import Conversion EnsemblId = 'ENST00000407559' # include your email a

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