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上传时间: 2022-01-30 01:46:50
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文件大小: 4KB
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文件类型: -
PythonProject_DataPrep
用于准备 TCGA 数据以进行分析的 Python。
概括:
combineMeth.py 和 combineExpr.py 可用于组合从 TCGA 下载的表达和甲基化数据。 只需在名为“data”(如代码中所写)的单独文件夹中包含所有 TCGA 数据的目录中运行代码。 如果您有一个不同名称的文件夹,或者您没有将所有数据放在单独的文件夹中,那么您可以在代码中进行相应的更改。
笔记:
如果您收到以下错误:“AttributeError: NoneType object has no attribute group”,则很可能是由于 TCGA 数据不同,正则表达式匹配存在问题。