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上传时间: 2021-07-20 16:36:33
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文件大小: 18.19MB
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文件类型: ZIP
AutoDock-GPU:适用于GPU和其他加速器的AutoDock
关于
OpenCL和Cuda加速版的AutoDock4.2.6。 它通过在多个计算单元上并行处理配体-受体姿势来利用其令人尴尬的可并行LGA。
OpenCL版本是与TU-Darmstadt合作开发的,能够针对CPU,GPU和FPGA架构。
Cuda版本是与Nvidia合作开发的,以便在Oak Ridge国家实验室(ORNL)峰会上运行AutoDock-GPU,其中包括Jubilee Development公司的Aaron Scheinberg开发的批量配体管线。
引文
使用GPU和基于梯度的本地搜索加速AutoDock4, 2021,10.1021 / acs.jctc.0c01006
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特征
基于梯度的本地搜索方法(例如ADADELTA),以及AutoDock 4中Solis-Wets的改进版本。
它针