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上传者: 42131276 | 上传时间: 2025-10-21 21:58:15 | 文件大小: 4KB | 文件类型: ZIP
一年级文件 我们从TERRA-REF的环境数据以及表型和基因型数据文件开始,后来又从KSU和Clemson添加了数据。 我们开发了机器学习/统计模型和贝叶斯信念网络来进行预测。 基因组数据 基因组数据的文档在。 有可用的HapMap文件和。 说明VCF和HapMap文件之间的区别。 HapMap文件是。 最初决定使用HapMap而不是VCF可能是因为已经拥有一个HapMap文件很方便。 VCF文件需要串联。 基因型数据包含有关X品种的信息。 将HapMap文件和表型与一起使用,以使用GWAS查找相关的SNP(HapMap文件中的行)。 GWAS的结果在。 hapmap-slim.vcf文件仅包含被GWAS发现与感兴趣的表型相关的SNP。 HapMap文件的结果不包含任何关于杂合性的信息,因此我们决定使用VCF文件,即使必须先将其串联。 VCF文件已连接在一起,可以在找到。 这些文件已导

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