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上传时间: 2021-11-26 14:15:08
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文件大小: 11KB
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文件类型: -
PDRi
快速开始
java -jar PDRi.jar reference.fasta assembly.fasta
介绍
PDR(P airwise d istanceřeconstuction)是基因组组装的评价度量。 它源于遗传学研究中的一个共同关注点,并考虑了完整性,连续性和正确性。 PDRi是其整体实现。
安装
PDRi只需要Java(1.8或更高版本)和BWA即可运行。 请转到下载PDRi.jar。
用法
java -jar PDRi.jar [Options]
Options:
--threads INT Threads to use [default: CPU core]
-k INT Block size [default: 1000]
-d PATH Tem