spede-sampler:运行GMYC的R Shiny App对选定文件夹(由FastTree或RAxML生产)中的所有树文件进行分析。 记录每棵树的簇和实体的数量,并将其存储在表中。 用户可以下载此数据和/或结果图

上传者: 42122988 | 上传时间: 2022-12-26 14:28:47 | 文件大小: 1.23MB | 文件类型: ZIP
R
速度采样器(GMYC) 该R Shiny App是SPEDE-SAMPLER程序的最后部分,允许用户在通过对对齐的Fasta文件中的序列进行随机重采样而创建的多个系统发育树上运行GMYC分析。 要通过R运行此应用,请在控制台中输入以下内容: install.packages("shiny") # install the shiny package library(shiny) # load up the shiny library shiny::runGitHub("spede-sampler", "CJMvS", ref="main") # run the app

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