TCGAhrd:TCGA PanCancer Atlas 中的同源重组缺陷-源码

同源重组缺陷 “我们根据之前公布的 HRD/基因组瘢痕评分的 3 个组成部分计算 HRD 评分：HRD-LOH（Abkevich 等人，2012 年）、LST（Popova 等人，2012 年）、NtAI（Birkbak 等人，2012 年）和实施三者之和（Marquard 等人，2015 年）。” -克宁堡（Knijnenburg）等 2019 年 6 月 6 日上午 10:12 从下载的分数。 然后将它们与可从以下获得的 PanCancer Atlas 临床数据相结合： : 。 基因表达数据可从以下下载： : 人力资源开发分数 来自 Knijnenburg 等人的 HRD 评分可用于 33 种癌症类型的 9125 个样本。 8602 份样本来自原发性实体瘤，162 份来自原发性血液来源的癌症 - 外周血，361 份来自mets。 所有 162 例原发性血源性癌症 - 外周血样本