RWRMTN:在 miRNA 靶基因网络上预测疾病相关 miRNA-开源

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microRNA 的错误调节已被证明是导致疾病的原因。最近，我们提出了一种基于 microRNA 目标基因网络上的随机游走框架的计算方法来预测疾病相关的 microRNA。与现有的最先进的基于网络和机器学习的方法相比，这显示出优越性，因为它很好地利用了 microRNA 目标基因网络中 miRNA 与其目标基因之间的相互调节。为了便于使用这种方法，我们开发了一个名为 RWRMTN 的 Cytoscape 应用程序来预测与疾病相关的 microRNA。 RWRMTN 可以在任何 microRNA 目标基因网络上工作。高排名的 microRNA 可以得到文献证据的支持。然后，它们也可以根据与查询疾病及其目标基因的关系排名进行可视化。此外，还集成了自动化功能，允许从外部工具使用 RWRMTN

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