PTESFinder:转录后外显子改组（PTES）识别管道-开源
PTESFinder是用于从高通量RNAseq数据中识别转录后外显子改组事件的计算管道。 PTESFinder利用已建立的RNASeq工具的功能，并通过应用旨在专门针对这些假阳性的严格过滤器，系统地排除所有已知类别的假阳性结构。 PTESFinder将映射到推定的PTES结构的读段的对齐质量与映射到基因组区域和规范剪接的转录本时具有相同读段的质量进行比较。 这种方法增加了对PTES支持阅读的信心。 当与转录组对齐时，模板切换事件产生的读段通常以大插入缺失为特征。 PTESFinder使用其他过滤器来排除PTES外显子-外显子连接点周围歧义对齐的读段，从而进一步提高了对这些支持读段的信心。 与其他已发布方法相比，PTESFinder可以识别更多的PTES结构，同时保持高度的特异性。
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