Bracken:蕨菜(用KrakEN进行贝叶斯丰度估计)是一种高度精确的统计方法,可以从宏基因组学样本中计算DNA序列中物种的丰度。-源码

上传者: 42117224 | 上传时间: 2022-02-22 13:15:40 | 文件大小: 146KB | 文件类型: -
C++
蕨菜2.6丰度估计 有关蕨菜的新闻,更新和说明,请访问: : Bracken的同行评审论文(2017年1月2日发布): : 安装 Bracken是Kraken 1或Kraken 2的配套程序,而Kraken在分类树中将读取分类为多个级别,而Bracken允许使用这些分类在单个级别上估计丰度(例如Bracken可以估计样本中物种的丰度)。 在安装Bracken之前,请先安装Kraken:可从此处下载Kraken: : 轻松安装Bracken: bash install_bracken.sh 硬蕨安装: cd src/ && make Add bracken/bracken-build and scripts in src/ to your PATH 重要信息:蕨菜与MPA风格的报告不兼容。 Bracken需要kraken / kraken2中的默认报告格式。 蕨菜2.5.

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