conda-r-python-snakemake:通过Conda使用R，Python和Snakemake进行可重现的分析-源码

在Conda环境中安装R，Python和Snakemake 通过Conda使用R，Python和Snakemake进行可重现的分析 该存储库包含安装脚本，用于自动安装R，Python和Snakemake以及在conda环境中用于生物信息学和数据科学项目的其他软件。 安装程序将安装1）r-base和r-essentials，2）python，JupyterLab和核心SciPy软件包，以及3）Snakemake工作流管理系统，允许在本地，群集和云平台上进行交互式或批处理分析。 安装程序还将通过创建以下项目来简化conda env中R的设置：项目级别的.Rprofile和.Renvironment文件，用于在R中设置项目级别的工作目录的.here文件，以及用于临时安装R的外部R库目录R软件包尚未在conda-forge或bioconda渠道上发布。 重要的是，当将R与conda一起使用时