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上传时间: 2021-11-13 16:11:51
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文件大小: 346.58MB
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文件类型: -
DTI-CDF
用于DTI预测的DTI-CDF的instruction文件。
介绍
药物-靶标相互作用(DTI)在基于靶标的药物发现和开发中起着至关重要的作用。 DTI的计算预测已成为进行DTI识别的既耗时又耗资源的实验方法的流行补充策略。 但是,当前的DTI预测方法的性能存在精度低和误报率高的问题。 在这项研究中,我们旨在开发一种新的DTI预测方法,称为DTI-CDF,以基于具有从异质图中提取的多个基于相似性的特征的级联深林模型来提高预测性能。 在实验中,我们在三种不同的实验数据集(即某些药物(SD),靶标(ST)或药物中的靶标对(SP)的相应DTI值)下建立了10倍交叉验证的五个重复样本。缺少训练集,但存在于测试集中。 实验结果表明,我们提出的方法DTI-CDF比现有技术具有更高的性能。 KEGG和DrugBank数据库证明有1352种新的DTI正确无误。
要求
此方法是使用Pytho