rodent-whole-brain-preprocessing-recipe:适用于小鼠和大鼠的全脑预处理工具箱-源码

啮齿动物全脑fMRI数据预处理工具箱 这是Nan Xu开发的适用于小鼠和大鼠全脑的fMRI预处理工具箱。 它遵循（ ）中所述的啮齿动物大脑预处理流程。 在此工具箱中，对（ ）中的初始预处理脚本进行了重新设计，以适应啮齿动物大脑的多个fMRI组数据集。 此工具箱已在具有不同成像和实验设置的啮齿动物的4个不同的fMRI全脑组数据集（3个大鼠组和1个小鼠组）上进行了测试。 可以获得合理的FC映射和QPP。 一，必备软件 FSL5.0，AFNI和ANTs-可以安装在PC上（请参阅“ SoftwareInstallation_fsl_afni_ants.txt”） Matlab中的PCNN3D工具箱（对于小鼠大脑预处理是可选的，请参见下面的详细信息）。 二。 资料档案 需要两个输入数据文件，每个输入数据文件的体素大小均比扫描文件大10倍（即，在使用Bruker2nifti生成.nii文件时，请