Subread:高性能阅读比对,定量和突变发现-开源

上传者: 42102358 | 上传时间: 2021-04-29 13:04:28 | 文件大小: 22.22MB | 文件类型: GZ
Subread软件包是用于处理下一代测序数据的工具套件。 它包括Subread对准器,Subjunc外显子-外显子结检测器和featureCounts读取摘要程序。 子读取比对仪可用于比对gDNA-seq和RNA-seq读取。 准准直器是专为检测外显子-外显子连接而设计的。 对于RNA-seq读图的映射,Subread执行局部比对,Subjunc执行全局比对。 Subread和Subjunc发表在以下论文中:廖扬,戈登·史密斯(Gordon K Smyth)和魏适(Wei Shi)。 “ Subread aligner:通过种子投票进行快速,准确和可扩展的读取映射”,Nucleic Acids Research,2013,41(10):e108

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