CRISPR-Offinder:CRISPR指导RNA设计和脱靶搜索-开源

上传者: 42097533 | 上传时间: 2021-10-10 10:50:52 | 文件大小: 148KB | 文件类型: -
简介:设计高效且特异的CRISPR小指南RNA(sgRNA)是成功应用CRISPR技术的关键之一。 重要的是,已发现越来越多的具有不同原间隔子相邻基序(PAM)的新的RNA引导的核酸内切酶。 因此,迫切需要开发一种通用的工具来设计sgRNA,以满足不同的RNA指导的DNA核酸内切酶的需求。 为此,开发了名为“ CRISPR-offinder”的灵活的sgRNA设计程序。 此新程序的最重要功能是它支持所有已知的PAM类型以及客户定义的PAM。 此外,CRISPR-offinder可以通过脱靶位点数量找到基因组中的候选sgRNA并对其进行排名,还可以用于设计单个或成对的gRNA。 CRISPR-offinder可作为命令行程序免费获得,也可通过我们的网站进行访问。 可用性:CRISPR-offinder可从http://crispr-offinder.com/或http://crispr.igenetech.com/免费获得。

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