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上传时间: 2021-11-09 11:35:45
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文件大小: 49KB
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文件类型: -
PyPDB
使用RCSB蛋白质数据库(PDB)执行搜索的Python 3工具箱。 这可用于对符合各种条件的PDB ID执行高级搜索,以及查找与特定PDB ID相关的信息。 该工具允许在Python脚本中执行可以在PDB网站中执行的标准操作(BLAST,PFAM查找等)。
每个函数及其相关输出的示例可以在找到。
如果您将此模块用于任何已发表的作品,请考虑引用随附的论文
Gilpin, W. "PyPDB: A Python API for the Protein Data Bank."
Bioinformatics, Oxford Journals, 2015.
截至2020年11月,为了适应RCSB PDB API的更改并扩展功能,pypdb正在进行大量重构。 对于此过程中发生的任何重大变化,我们深表歉意。 pypdb的先前版本可; 但是,它将不再对更改的RCSB API起