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上传时间: 2021-12-25 15:50:31
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癌症基因组的系统测序显示出普遍的异质性,患者具有多种遗传改变的组合模式。 特别是,一组基因表现出互斥模式的现象已在各种癌症中广泛传播,涵盖了广泛的关键癌症途径。 最近,有大量证据表明,互斥性反映了肿瘤发生和发展中的替代功能,或暗示了它们并发的不利影响。 鉴于其重要性,已提出了许多计算方法来单独使用基因组图谱或通过整合网络和表型来研究相互排他性。 其中一些已被常规用于探索遗传关联,从而使人们对致癌机理有了更深入的了解,并揭示了意料之外的肿瘤脆弱性。 在这里,我们从癌症基因组的角度介绍了互斥性。 我们描述了互斥性的共同假设,总结了重要互斥模式的识别策略,从模拟数据集中比较了代表性算法的性能,并讨论了它们的共同混杂因素