均匀阵列方向图的matlab源代码-compvision:DRMaize项目的计算机视觉资源

均匀阵列方向图的matlab源代码玉米博士的计算机视觉资源概述 玉米博士项目对玉米中的真菌病原体进行成像，以测量病原体的行为和相互作用。 为此，在此分析任务的管道中开发了许多自动计算机视觉方法。 CV功能包括表面估计，图像/堆栈分割（细胞，真菌，气Kong，孢子），骨架化和定量测量计算。 这些工具可通过可免费下载和运行的源代码获得，也可通过包含安装程序和运行所需组件的每个组件的打包发行版获得。 许可和访问 DrMaize CV代码是根据GNU GPLv3开源许可证发布的。 源代码在GitHub上发布： 依赖关系因每个模块而异，并在各自的部分中列出，但是在将来的更新中，我们将与Docker一起发布。 可运行的可执行文件和安装程序在GitHub上可用： 深度学习权重和模型也可以在GitHub上获得： 斐济ImageJ可以找到： 表面估计 表面估计是获取3D堆栈并从上方为2D视图中的每个像素查找表面深度的过程。 这样可以量化病原体的深度和量化植物表面的特征（例如，气Kong分割和位置）。 我们使用主动轮廓/蛇优化和统一初始化的控制点来执行此操作。 它是在Matlab 2017中开发的，最近在