DFT的matlab源代码-GASpy:间谍

DFT的matlab源代码GASpy：适用于Python的通用吸附模拟器 我们使用密度泛函理论（DFT）来计算被吸附物在平板上的吸附能，但是我们尝试以一种通用的方式进行计算，以便我们可以对任意数量的构型进行这些计算-例如，不同的散装材料，刻面，吸附部位，被吸附物等 概述 GASpy是用编写的，我们使用各种工具（如下）使我们能够执行高通量DFT放宽。 您可以在中找到我们的依赖项的完整列表。 ，，，，，， 我们创建了各种Python类（称为），以自动进行吸附能计算。 例如：我们的任务是从“材料项目”中获取体结构，然后将其转换为ASE原子对象； 我们的任务是使用PyMatGen从这些散装结构中切出板坯； 我们的任务是使用PyMatGen枚举这些平板上的吸附位； 我们的任务是将吸附物添加到这些位置； 我们的任务是根据平板，被吸附物和平板+被吸附物的弛豫来计算吸附能。 我们使用Luigi管理这些任务之间的依赖关系（例如，我们的平板切割课程要求我们获取批量结构），并且使用FireWorks管理/提交跨多个群集的DFT仿真。 因此，我们可以简单地告诉GASpy“计算CO在Pt上的吸附能”，它会自动执