上传者: 38697579
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上传时间: 2021-12-20 18:39:29
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文件大小: 7.56MB
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文件类型: -
冲浪配准数学代码视网膜检影
处理结构图像
从原始的.dcm文件开始
在我们的示例中,.dcm文件位于名为str_raw的文件夹中
您需要以下结构
SUBJ01
|--structural
|--struct_1
|--str_raw
00000001.dcm
....
00000180.dcm
运行以下代码(我始终在akalla中运行该代码)
tcsh
source
/usr/local/freesurfer/SetUpFreeSurfer.csh
setenv
SUBJECTS_DIR
~/Desktop/Distractor_project/imaging/David/structural/struct_1
cd
$SUBJECTS_DIR
recon-all
-i
str_raw/00000001.dcm
-subject
David_struct1
-all
因为我想在本地获取结构化数据,所以我使用以下几行代码通过scp将其从服务器中移出
scp
-r
davsan@akalla.cns.ki.se:~/Desktop/Distractor_project/imaging/Da