一系列非核苷HIV-1逆转录酶抑制剂的基于受体和配体的3D-QSAR研究

通过比较分子场分析（CoMFA）和比较分子相似性指数分析（CoMSIA）对一系列HIV逆转录酶（RT）非核苷抑制剂（2-氨基-6-芳基磺酰基苄腈及其硫代和亚磺酰基同类物）进行了分子建模。 ）方法。 采用对接模拟将抑制剂置于RT活性位点，以确定最可能的结合模式和最可靠的构象。 使用复杂的基于受体和基于配体的比对程序进行了这项研究，并研究了不同的比对模式以获得具有交叉验证的q（2）值分别为0.723和0.760的高度可靠和可预测的CoMFA和CoMSIA模型。 此外，获得了带有目标3D结构（RT的结合位点）的CoMFA和CoMSIA等高线图，以更好地理解RT蛋白与抑制剂之间的相互作用以及对HIV-1抑制活性的结构要求。 我们表明，要使2-氨基-6-芳基磺酰基苯甲腈抑制剂具有明显的抑制活性，需要在B环的3位和5位具有大体积和疏水性的基团。 此外，在A环的2-位上与RT蛋白的Lys101残基建立H键的H键供体基团也对活性有利。