matlab贪婪算法代码-SMSC:scRNA-seq的一种谱聚类方法
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scRNA-seq的一种谱聚类方法
使用
computeKernel.m
计算内核
run.m
是主要入口。
selfweightmkl.m
由
run.m
调用，它自动为所有内核分配权重。
我们提供了一个关于
Yan
数据集的演示。
您只需要下载代码并设置正确的路径，然后运行run.m函数即可。
该项目中的文件夹包含
scRNA-Seq
表达数据和计算内核。
输入：data.m
输出：results.txt
**
聚类：
FINCH：第一个整数邻居聚类层次（FINCH）算法
Matlab
：请进入您复制此文件夹的路径或将其路径添加到您的
Matlab
路径中。
[c,
num_clust]=
FINCH(data,
initial_rank,
verbose);
输入：
数据：数据矩阵（行中的特征向量）
initial_rank
[可选]：Nx1（1
个邻居）索引向量。
传递空
[]
以通过
pdist
或
flann
计算第一个邻居
详细信息：打印一些输出
输出：
c:
N
x
P
矩阵每个列向量包含每个分区
P
的簇标签
num_clust：显示
文件下载
资源详情
[{"title":"（ 139 个子文件 118.35MB ） matlab贪婪算法代码-SMSC:scRNA-seq的一种谱聚类方法","children":[{"title":"run.m <span style='color:#111;'> 232B </span>","children":null,"spread":false},{"title":"Tingexpression.mat <span style='color:#111;'> 2.60MB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"guassion-100.mat <span style='color:#111;'> 150.90KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"kernel-polynomial-a1-b2.mat <span style='color:#111;'> 163.54KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"kernel-polynomial-a0-b4.mat <span style='color:#111;'> 164.98KB </span>","children":null,"spread":false},{"title":"......","children":null,"spread":false},{"title":"<span style='color:steelblue;'>文件过多，未全部展示</span>","children":null,"spread":false}],"spread":true}]
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