重采样matlab代码-PUMA:PANDA使用MicroRNA关联

上传者: 38654855 | 上传时间: 2022-03-04 10:13:17 | 文件大小: 36KB | 文件类型: -
重采样matlab代码彪马 PANDA 使用 MicroRNA 关联 PUMA,或P ANDAü唱中号icroRNA甲ssociations,是基因调控网络的重建算法PANDA,将其通过玻璃K,Huttenhower C,夸肯布什Ĵ,元发表于“生物网络之间传递消息来细化预测相互作用”的扩展GC。 公共科学图书馆一。 2013 年 5 月 31l8(5):e64983,doi:10.1371/journal.pone.0064832,PMID:23741402 PUMA 可以使用转录因子和 microRNA 作为 mRNA 表达水平的调节器来重建基因调节网络。 此 Github 存储库包含 C++ 版本和 MATLAB 版本的 PUMA。 C++ 版本基于 PANDA 版本 2。原始 PANDA C++ 代码位于:。 运行 PUMA 的 MATLAB 脚本的选项比 C++ 代码少,但运行速度更快。 C++代码 PUMA 的 C++ 代码和运行 PUMA 的示例文件可以在文件夹PUMAc找到。 可以使用以下代码编译代码: g++ PUMA.c -O3 -o PUMA 运行 PUMA 的假设

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