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上传时间: 2022-03-04 10:13:17
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文件大小: 36KB
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重采样matlab代码彪马
PANDA
使用
MicroRNA
关联
PUMA,或P
ANDAü唱中号icroRNA甲ssociations,是基因调控网络的重建算法PANDA,将其通过玻璃K,Huttenhower
C,夸肯布什Ĵ,元发表于“生物网络之间传递消息来细化预测相互作用”的扩展GC。
公共科学图书馆一。
2013
年
5
月
31l8(5):e64983,doi:10.1371/journal.pone.0064832,PMID:23741402
PUMA
可以使用转录因子和
microRNA
作为
mRNA
表达水平的调节器来重建基因调节网络。
此
Github
存储库包含
C++
版本和
MATLAB
版本的
PUMA。
C++
版本基于
PANDA
版本
2。原始
PANDA
C++
代码位于:。
运行
PUMA
的
MATLAB
脚本的选项比
C++
代码少,但运行速度更快。
C++代码
PUMA
的
C++
代码和运行
PUMA
的示例文件可以在文件夹PUMAc找到。
可以使用以下代码编译代码:
g++
PUMA.c
-O3
-o
PUMA
运行
PUMA
的假设