matlab图像分割肿瘤代码-tractography-visualization:基于香农熵的牙线学纤维的最佳可视化

上传者: 38654855 | 上传时间: 2021-12-15 13:05:51 | 文件大小: 3.87MB | 文件类型: -
matlab图像分割肿瘤代码基于熵的医学影像学可视化工具 该代码提供了用于可视化牙龈纤维的工具。 它提供了后处理算法,可以过滤纤维并选择带有神经和肿瘤的3D场景中的最佳视点。 输入数据 该代码获取的输入数据是由描记软件产生的描记纤维文件。 数据格式可以是Mrtrix tck文件或DSIstudio txt文件。 如果纤维是由Mrtrix生产的,请确保使用体素坐标。 要将结果转换为体素坐标,可以使用Mrtrix的tckconvert函数,如在Shell文件夹中找到的Shell脚本中所述。 如果要向可视化添加片段(例如肿瘤),则必须以nifti格式将其作为二进制图像提供。 使用DSIstudio进行的细分与代码兼容,但是任何其他细分都可能导致错误的放置。 在“数据”文件夹中提供了跟踪的颅神经和颅骨肿瘤分割的样本数据。 筛选 提出了一种基于弹力纤维熵计算的滤波算法。 主文件中提供了使用此算法的示例。 要执行过滤,必须首先使用Entropy / entropy_matrix函数计算纤维的熵。 然后,运行Filtering / filter_nerve删除对于可视化而言意义不大的纤维。 您必须提

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