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上传时间: 2022-05-10 12:09:59
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文件大小: 373KB
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文件类型: ZIP
二摘代码MATLAB
KilosortPLX
使用Kilosort对Plexon(.plx和.pl2)文件进行排序使用Kilosort对Plexon数据进行排序Kilosort是一种电生理数据排序程序,主要运行在Matlab中。
然后可以使用Python软件包phy显示排序的数据并进行编辑。
可从此处下载的文件来自Kilosort()和Plexon的(OmniPlex和MAP
Offline
SDK
Bundle,)文件,已编辑并放置在一起,以供Kilosort处理Plexon数据。
软件要求:
•Matlab(2015b或更高版本,如果使用GPU)•Python
miniconda
64位按照的说明安装phy-contrib,这将提供模板GUI来显示数据并允许进行其他手动排序环境文件:
Kilosort安装:
下载所有文件,并将它们一起放在计算机上的一个千分之一文件夹中
在您的Kilosort文件夹中创建一个“
RawData”文件夹,然后将要排序的文件放入该文件夹中。
在PLXMasterFile.m文件中,将PATH变量编辑为您的千分之一文件夹的路径。
使用双斜杠而不是单斜