综合组学研究描述了不透明红球菌PD630中脂滴的动力学

不透明红球菌菌株PD630（R. opacus PD630）是一种油性细菌，也是少数几个含有脂质小滴（LDs）的原核生物之一。 LD是脂质存储的重要细胞器，但也是有关能量代谢的细胞间通讯，但细胞细胞器却知之甚少。 为了了解使用简单模型生物的LD动力学，我们对opacus PD630进行了一系列全面的组学研究，包括完整的基因组，转录组和蛋白质组分析。 R. opacus PD630的基因组编码8947个在脂质转运，合成和代谢中显着丰富的基因，表明碳源生物合成和分解代谢具有超强的能力。 来自三种培养条件的比较转录组分析揭示了负责脂质积累的基因改变的表达方式。 LD蛋白质组学进一步鉴定了介导脂质合成，储存和其他生物学功能的蛋白质。 整合这三个组学发现了177种可能参与脂质代谢和LD动力学的蛋白质。 进一步证实了LD结构样蛋白LPD06283影响LD形态。 我们的组学研究不仅提供了对原核LD细胞器的首次综合组学研究，而且还为促进进一步的原核LD研究和生物燃料开发提供了系统平台。