nmf的matlab代码-won-parafac:加权正交非负(WON)并行因子分析(PARAFAC)

上传者: 38565221 | 上传时间: 2021-09-02 16:30:54 | 文件大小: 14.05MB | 文件类型: ZIP
nmf的matlab代码元帕拉帕克 加权正交非负(WON)并行因子分析(PARAFAC) WON-PARAFAC是并行因子分析(PARAFAC)的一种变体,即张量因子分解方法。 WON-PARAFAC对标准PARAFAC施加以下三个约束: 加权方案 用于多种数据类型的均衡集成 正交约束 减少一个因素之间的重叠(最初在基因模式下使用)。 这也引入了模式上的额外稀疏性。 非负性 诱导稀疏和基于零件的表示。 实现/依赖 就像在最初的NMF实现中一样,使用了一个乘法更新规则来推导该算法。 该代码要求,注册后可免费用于非商业用途。 为了运行代码,使用MATLAB中的addpath命令,tenstor toobox必须在路径环境中可用。 演示代码和数据 您可以加载演示数据,其中包含在中产生的泛癌多组学数据。 您可以通过以下方式加载数据: load Demo.mat 该命令将加载一个3向张量varialbe X (由935个细胞系和5种数据类型组成的1815基因)。 请注意,这5种数据类型对应于以下内容: 正基因表达水平(非负连续; GE(+)) 负基因表达水平的绝对值(非负连续; GE(-)) 突

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