SSPACE for scaffolding

上传者: jjjscuedu | 上传时间: 2021-12-17 22:30:46 | 文件大小: 2.52MB | 文件类型: -
The main featues are; * Inputs are simple FASTA contig sequences as well as (multiple) FASTA/FASTQ paired-read data * High-quality scaffolds in a short runtime and limited memory requirements * High reduction of the amount of contigs stored into scaffolds and high N50 value * Multiple library input of both paired-end and/or mate pair datasets * Possible contig extension of unmapped sequence reads * Easy interpretation of the final scaffolds * Visualization of the final scaffolds using GraphViz

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