概述
EggNOG-mapper是一种用于对新序列进行快速功能注释的工具。 它使用来自eggNOG数据库( )的预先计算的直系同源基因组和系统发育树,仅从细粒度直系同源基因中转移功能信息。
eggNOG-mapper的常见用途包括注释新的基因组,转录组甚至宏基因组基因目录。
使用正交预测作为功能注释的方法比传统的同源搜索(即BLAST搜索)具有更高的精度,因为它避免了从紧密的旁系同源物转移注释(重复的基因更有可能参与功能差异)。
将不同的eggNOG-mapper选项与BLAST和InterProScan进行比较的基准。
EggNOG-mapper也可以作为公共在线资源获得: ://eggnog-mapper.embl.de
文献资料
引文
如果您使用此软件,请引用:
[1] Fast genome-wide functional annotation through orth
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