SNP_calling_GATK
这是运行GATK调用高质量SNP的逐步步骤，它旨在在集群上运行。
该脚本是通过实施Genome Analysis Toolkit（GATK）而构成的全基因组植物SNP调用管道的一部分。
有关GATK的更多信息，请访问： ://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us
可以在github中找到此管道的详细说明： :
作者：Taslima Haque
上次修改时间：2021年2月12日
请将您的查询发送给作者： 或
它期望什么？
这是每个脚本的示例标头，它们期望跟随变量：
refDir = / work / 02786 / taslima / dbs / PH＃参考基因组文件所在的参考目录
ref = PhalliiHAL_496_v2.0.softmasked.fa＃参考基因组文件的名称
outDir = / scratch
2022-03-19 10:06:22
38KB
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华为 MA5675 V800R16C00SPH205，此版本仅用于MA5675设备，附带补全Shell
2022-03-19 06:08:37
27.47MB
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硬件版本为TQ2440，把原来ads下的2440的ucosii移植到了keil下。增加了shell查询、打印任务信息的功能。已测试通过。
2022-03-18 21:31:07
535KB
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shell-mysql
使用shell脚本分页读取MySQL数据
脚本背景
由于要在Linux上，远程读取mysql的表的数据，然后做一定清洗后，把数据上传至Hadoop集群中，使用Java写吧，感觉太麻烦了，得在Win上开发好，还得打成jar包，
上传到Linux上，如果那里出了问题，还得重复这样，非常不方便，那就用shell写一个吧，也不需要什么jdbc驱动包，只需要在Linux上装个MySQL的
客户端即可，用一行yum命令即可搞定，所以就花了点时间，封装了一个小脚本
功能介绍
直接在Linux下使用shell脚本远程分页读取MySQL表的数据的一个小脚本，已测过读取600万+的数据
效率与jdbc相差无几
脚本介绍
主要有三个脚本构成1，page.sh 这是一主脚本，里面定义了分页的条件，大家看下便知2，f.sh 一个小包装的脚本吧，里面会用sed去掉表头一些信息3，port.
2022-03-17 16:00:49
4KB
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golang本地执行linux服务器命令(用于自动化部署很 爽哦)
golang本地执行linux服务器命令(打包为exe应用用于自动化部署很 爽哦)
golang本地执行linux服务器命令(用于自动化部署很 爽哦)
golang本地执行linux服务器命令(用于自动化部署很 爽哦)
2022-03-16 10:11:43
7KB
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Linux最重要的软件之一就是shell，目前最流行的shell被称为Bash，几乎所有的Linux和绝大部分的UNIX都可以使用Bash。作为系统与用户之间的交互接口，shell几乎是你在Linux工作平台上最亲密的朋友，因此，学好shell，是学习Linux的关键，并且它会始终伴随你的工作学习。共同加油吧！
2022-03-16 08:03:45
2.77MB
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