MATLAB用拟合出的代码绘图变更点检测和理想观察者分析
该存储库包含一个工具箱,用于对IBL任务进行模型拟合和理想观察者模型的绘制。
目前,该代码仅在Matlab中可用。
安装指南
或在本地计算机上克隆存储库。
将存储库的基本文件夹(包含ibl_changepoint_add2path.m文件)添加到Matlab路径。
警告:不建议将整个存储库树永久添加到您的Matlab路径,因为这可能导致函数名称与其他项目冲突。
如果尚未安装它们,则从中安装Bayesian自适应直接搜索(BADS;优化工具箱),从中安装Variational
Bayesian
Monte
Carlo
(VBMC;近似后验工具箱)。
使用(将需要IBL访问凭据)将示例小鼠的IBL数据下载到data文件夹中的CSV文件中。
基本概述
举一个简单的例子,我们假设一个“无所不知”的贝叶斯观测器适合鼠标稳定会话数据,并假设存在偏差(请参见下面的说明)。
示例小鼠是CSHL_005
,
CSHL_007
,
IBL-T1
,
IBL-T4
,
ibl_witten_04
,
ibl_witten_05
;
我们将在这里适合第
2022-05-18 08:34:08
208KB
系统开源
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