Alphafold2-Pytorch(WIP)
要最终成为一个非官方的工作Pytorch实施 ,令人叹为观止的注意网络解决CASP14。 随着体系结构的更多细节发布,将逐步实施。
复制完成后,我打算将所有可用的氨基酸序列在计算机上折叠起来,并作为学术洪流发布,以供进一步科学使用。 如果您对复制工作感兴趣,请在此#alphafold
安装
$ pip install alphafold2-pytorch
用法
像Alphafold-1一样预测分布图,但要注意
import torch
from alphafold2_pytorch import Alphafold2
from alphafold2_pytorch . utils import MDScaling , center_distogram_torch
model = Alphafold2 (
dim = 256 ,
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