化学气相沉积是半导体工业经常使用的工艺，用于在晶片衬底上生长高纯度硅，基于comsol对超高真空化学气相沉积进行模拟，依靠输入流量和压力控制，可得到表面气相分布分数。

可以适合新手学习分子动力学模拟和借助fortran进行分子动力学建模的学习

C.使用EAM势模拟Ni的循环行为 u z x y 常温30K条件下 u u

MUTAG—化学分子和化合物的数据集 MUTAG是一个关于化学分子和化合物的数据集，原子代表结点，化学键代表边，包含188个硝基化合物，labels是判断化合物是芳香族还是杂芳族。

通常标准式传输函数的分子分母进行因式分解 H(z)= K(z – z1)(z – z2)…(z – zM) (z – p1)(z – p2)(z – p3)…(z – pN) zj称为滤波器零点，在 z 复平面上用 ○表示； pj称为滤波器极点，在 z 复平面上用 ×表示； K称为滤波器增益。 Z 平面上零极点的位置可以给出滤波器特性的迹象。

采用Adams嵌入原子势(EAM),利用分子动力学方法对单晶A1的熔化过程进行了模拟,分析了A1样品体熔化过程中结构、能量的变化及表面熔化过程中固一液界面的移动情况。模拟的结果表明:对于A1样品体熔化过程,体系的体积和内能在1205K发生突变;通过计算1000-1200K下A1的表面熔化速度,得出热力学熔点为985K,与存在的实验结果基本吻合。

毕业论文附录B

Si端面β-SiC(001)表面的原子结构随温度变化的分子动力学模拟，马梨，赵耀林，本文采用了Tersoff/ZBL势对不同温度下Si端面的β-SiC(001)表面的原子结构进行了分子动力学（MD）模拟研究。模拟发现，各温度下Si端面的β-Si

基于罗丹明6G 的分子荧光原理，通过对比不同实验条件下得到的罗丹明6G 荧光光谱，得出pH 为1条件下的相对荧光强度最大。罗丹明6G 试剂中加入钼酸铵、磷酸二氢钾、硫酸试剂生成络合物后，罗丹明6G 的相对荧光强度值有所下降，在一定范围内表现出线性关系，罗丹明6G 荧光峰的位置没有发生变化。基于遗传算法-逆向误差传播(GA-BP)神经网络构建了输入节点数为36×18的矩阵、输出节点数为1×18的矩阵、以检测磷酸盐浓度为目的的非线性模型。网络训练中，误差精度为10-3，输出与期望的相关系数为0.998，网络预测中，平均回收率为99%，平均标准偏差值为1.79%，达到了理想的检测效果。证明此网络适用于检测0~2.00 mg/L 的磷酸盐溶液。提供了一种快速、有效检测磷酸盐浓度的方法，有助于环境检测技术的发展和应用。

从Hadder看蛋白质分子中的加氢算法.doc