HMM倍性：基于基因型和覆盖率的隐马尔可夫模型，用于推断倍性水平。
推断倍性水平，检测非整倍性和其他物质的工具。 计算其等位基因频率和基因型可能性，需要下载以下内容：
python 3，带有gzip, numpy, scipy, statistics软件包
R，带有pracma, data.table, Rcpp, getopt包pracma, data.table, Rcpp, getopt
samtools
多倍体数据模拟
概述：模拟多倍体生物并以mpileup.gz格式输出
simulationScript.sh -p $FILE -d $DEPTH -l $LOCI -o $OUTNAME
输入
-p或--ploidyFile ：包含所需模拟数据的文件（请参见下文中的sintax）。 ploidyFile每一ploidyFile包含倍体数和基因组$ J $的$ K $相邻片
2021-11-29 10:29:32
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东北大学马克思主义基本原理概论参考练习，部分题目与考试题目相同，不保证完全一致，不排除题库更新的可能，仅供学习参考
2021-11-29 10:09:34
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GAMMA_INCOMPLETE 计算上不完全伽马函数（第二类不完全伽马函数）$\Gamma(a,x)$ 在参数的非负值处。 此功能扩展了MATLAB函数gammainc为参数a的负值。
概要： fun=gamma_incomplete(x,a)
输入 x : 函数参数一：参数
OUTPUT fun : 与 x 长度相同的向量； 它包含 NaN 值在 x 的元素为负的地方。 备注 1. 该函数扩展了 MATLAB 函数 gammainc 为参数a的负值。 2. 对于正 a 这个函数是等价的调用 fun=gamma(a).*gammainc(x,a,'upper'); 例子
x = 0.01：0.01：8; f=gamma_incomplete(x,1); 情节（x，f）；
x=0.001:0.001:.1; f=gamma_incomplete(x,-2.3); 情节（x，f）；
2021-11-28 21:27:12
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Feedvisor-品牌&亚马逊：电子商务时代的机遇和焦虑（英文）-2019.4-20页.zip
2021-11-28 21:07:27
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聚类马氏距离代码MATLAB
从细胞计数数据学习单细胞距离
该存储库随附有，，，N.
Boon，B。De
Baets和W.
Waegeman撰写的手稿“从细胞计数数据学习单细胞距离”。
它通过针对不同的细胞计数应用（合成微生物生态学和CyTOF）最大化Jeffrey散度（DMLMJ），探索了距离度量学习的功能。
抽象的：
用于自动识别细胞群的数据分析技术在细胞计数领域的兴趣日益浓厚。
这些技术通常依赖于距离度量来测量单个单元之间的相似性。
在这项研究中，我们探索使用距离度量学习来自动确定欧氏距离度量的广义形式，即所谓的马哈拉诺比斯距离度量。
在单细胞标签可用的情况下，可以使用这种方法。
我们以各种方式评估学习距离度量的潜力。
首先，我们表明可以通过实施适当的Mahalanobis距离度量来改进当前基于距离的方法。
然后，为了评估这种距离度量的鲁棒性，我们评估了Mahalanobis距离度量在样本之间的可传递性。
此外，我们表明，可以将学习的距离度量与无监督方法（例如聚类或降维）集成在一起。
特别地，示出了用于来自两个不同来源的细胞计数数据的方法，即应用于微生物细胞的流式细胞计数和用于人
2021-11-28 21:02:03
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