MIMIC_ICU代码存储库
定义和比较MIMIC-III数据库中现有ICU再入风险评分的代码。 它由以下核心模块组成。
extract_patients
该模块使用MIMIC-III数据库并通过资格标准进行筛选,以生成“可用” ICU患者的数据集,可以随时对其进行重新定义。 出于数据安全原因,此数据集文件将不会上传到github。 目前提取出接受手术治疗或转为手术治疗的患者。
preprocess_data
对于在extract_patients中定义的所有患者,此模块将预处理有关其人口统计信息和ICU停留时间的所有MIMIC数据。 这个过程很大程度上遵循Lin等人的工作流程。 2018年1月,可以在Python代码中找到和 。 它输出选定患者的所有人口统计,住院/转移和输入(诊断/过程/处方)数据。
split_events
该脚本将“事件”表(chartevents,input
2021-05-06 14:57:48
24.56MB
R
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