matlab分时代码介绍
IsoScope是一个开放源代码,用户友好的软件包,用于可视化并执行质谱成像(msi)数据的数据分析,重点是同位素标记。
该软件包最初是使用Bruker的solariX数据设计和测试的,但也可以采用标准的.imzML数据格式。
IsoScope具有数据解析,处理,峰检测,图像浏览,质谱浏览,关注区域(ROI)选择,数据提取,图像叠加等基本功能。IsoScope能够轻松分析同位素标记的成像数据而出类拔萃(包括13C,15N,2H和13C15N双示踪剂)。
具体来说,只需单击几下,该软件即可显示同位素标记形式或代谢物的平均碳原子标记的空间图像,包括在自然同位素丰度校正之后。
数据输入
IsoScope将matlab结构的“
.mat”数据作为直接输入,在峰选择后已经对其进行了处理,其大小要小得多,并且仅包含质心质谱峰。
因此,请先使用提供的工具从原始图像数据进行转换。
它可以采用三种类型的原始数据:
成对使用相同文件名的.imzML和.ibd文件的标准成像数据格式
错误文件以及同名的.d文件夹,即flexImaging(来自Bruker的商业软件)加载的文件。
这
2021-11-24 10:53:49
18.57MB
系统开源
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