MSMBuilder的 MSMBuilder是一个python软件包,它为高维时间序列实现了一系列统计模型。 它特别专注于生物分子动力学的原子模拟的分析。 例如,MSMBuilder已用于通过分子动力学(MD)模拟对蛋白质折叠和构象变化进行建模。 LGPL(v2.1或更高版本)提供MSMBuilder。 功能包括: 将特征提取到二面体,联系方式等中 具有多种算法的几何聚类。 使用时间结构独立成分分析(tICA)和主成分分析(PCA)进行降维。 马尔可夫状态模型(MSM)的构造 率矩阵MSM构造 隐藏马尔可夫模型(HMM)构造 时标和过渡路径分析。 在查看文档,并加入。 有关MSMBuilder的更广泛概述,请看一下我们的。 安装 对于优选的安装机构msmbuilder与conda : $ conda install -c omnia msmbuilder 如果您没有cond
2024-04-30 19:04:32 2.28MB python analysis clustering
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该存储库包含用于跨音速导弹系统飞行动力学仿真的MATLABSimulink仿真软件。___下载.zip
2024-04-29 21:01:05 1.39MB
Cellulose-builder 是一个用户友好的程序,可以构建不同尺寸和几何形状的纤维素晶体结构。该程序以蛋白质数据库格式为指定结构的所有原子生成笛卡尔坐标,适合用作分子动力学模拟和其他计算中的起始配置。纤维素多晶型物 Iα、Iβ、II 和 III I的晶体结构实际上任何尺寸的纤维都可以很容易地构建,包括平行六面体、任何长度的植物细胞壁纤维素基本原纤维和单层。
2024-04-29 17:24:47 450KB 分子动力学
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流体 内容 什么是流体? Fluids 是面向在化学、机械或土木工程领域工作的工程师和技术人员的开源软件。 它包括管道、配件、泵、罐、可压缩流、明渠流、大气特性、太阳能特性、粒度分布、两相流、摩擦系数、控制阀、Kong板和其他流量计、喷射器、减压模块阀门等。 流体库旨在成为与流体动力学相关的工程知识和实用程序的低开销、轻量级存储库。 Fluids 最初与 SciPy 和 NumPy 紧密集成; 今天,它们是可选组件,仅用于少量功能,没有实现纯 Python 数值方法。 Fluids 面向 Python 2.7 及更高版本以及 PyPy2 和 PyPy3。 此外,流体已被作者测试加载到 IronPython、Jython 和 micropython 中。 虽然 Fluids 中的例程通常非常快并且尽可能高效地编码,但根据应用程序,仍然可能需要更高的速度。 PyPy 为大多数方法提
2024-04-27 18:55:23 2.99MB engineering pipeline pipe drag
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基于adams和hyperworks的蜗轮蜗杆刚柔耦合仿真及动力学分析
2024-04-26 17:09:26 434KB adams,
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阐述了绝对节点坐标十几年来的研究进展,引用文献充足。
2024-04-19 15:19:30 1.62MB 绝对节点坐标
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基尔霍夫椭圆涡旋是嵌入在无粘性、不可压缩和无旋流体中的均匀涡度的二维椭圆区域(或“补丁”)。 G. Kirchhoff 在 1876 年证明了这些是非线性欧拉方程的精确解。 随后,AEH Love 分析了基尔霍夫涡旋的线性稳定性,并确定在大纵横比下它们是不稳定的。 他还获得了振荡频率和增长率的解析表达式。 自述文件中包含了他的论文的抄录,该论文于 1893 年发表在伦敦数学学会会刊上。 1979 年,NJ Zabusky、MH Hughes 和 KV Roberts 引入了一种现在通常称为“轮廓动力学”的数值方案。 这是一种用于模拟无粘性离散涡量块的流行工具。 它在数值上是有效的,因为跟随均匀涡度区域的演变只需要跟踪其边界。 我们在 Matlab 中实现了轮廓动力学算法,以重新检查基尔霍夫涡旋的演变,重点是系统的模式。 包括两个拟合例程,将解分解为组成的线性特征模式。 这些例程的一些
2024-04-12 11:24:03 816KB matlab
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假设彩色单重态t通道交换具有大的动量传递t,则研究了在LHC能量下pPb碰撞中矢量介子的光子产生。 考虑到BFKL的非正向解,估计了过程Pbp→Pb⊗V⊗jet+ X的速度分布和总横截面,其中V =ρ,J /Ψ和the表示最终状态下的速度差距。 高能量和大t时的方程。 还提出了与在出生水平获得的预测的比较。 我们预测LHCb协作探测的运动范围内与BFKL动力学相关的横截面将大大增强。 此外,我们的结果表明,在大型强子对撞机上进行实验识别是可行的,并且该过程可用于探测BFKL动力学。
2024-04-08 11:27:13 408KB Open Access
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我们表明,在大型强子对撞机的质子-铅(p + Pb)碰撞中,彩色玻璃冷凝物(CGC)和流体动力学导致质构平均横向动量〈p⊥〉随质子速度而变化。 在流体动力学中,sincep⊥〉随着从零速度y = 0到质子碎片化区域的减少而减小,因为粒子数量减少了。 相反,在CGC中,饱和动量随着从y = 0到质子分裂区域的增加而增加,因此〈p⊥〉增加。 在大型强子对撞机上,两个模型之间的差异可能足够大,可以通过实验进行测试。
2024-04-08 04:14:48 314KB Open Access
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我们在(1 + 1)维设置中呈现U(1)-Higgs模型的两个不同系列的解决方案,从而实现了规范场的本地化。 首先,我们考虑统一的背景(通常为真空),它对应于完全滞后的超导阶段。 然后,我们以畴壁的形式研究背景不均匀的情况,该背景可能与相关的自发对称性破坏的临界点接近。 对于这两种情况,我们获得近似解析
2024-03-25 04:21:38 1.64MB Open Access
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