脂蛋白是从家畜衍生的过敏原之一,对过敏反应的发展具有临床重要性。 它们在不同的动物中都有特征。 具有致敏能力的特征,对于涉及过敏反应的表位知之甚少。 在这里,通过生物信息学工具探索了脂蛋白之间交叉反应的潜在抗原区域。 通过系统发育研究,使用了来自不同家畜(小鼠,狗,猫,公牛,仓鼠,马和猪)的几种脂蛋白的氨基酸序列来确定亲缘关系。 通过使用MEGA软件获得具有最高系统发育关系的组。 通过同源性对未在蛋白质数据库中报告的脂蛋白的3D模型进行建模,以识别在这组过敏原的交叉反应性中受损的潜在抗原区域。 变应性脂蛋白的整个数据库和推断的最大似然树的比对将脂蛋白分为五个单系进化枝(此处称为A,B,C,D和E)。 根据多重配对分析,C组(Fel d 4,Rat n 1和Equ c 1)在其氨基酸序列中显示出最高的同一性(58%)。 对保守和暴露残基的分析表明,C组共有三个抗原性区域,可能会促进其交叉反应。 确定了潜在的抗原性位点,用于在本研究中分析的不同脂钙蛋白之间产生交叉反应。 这些研究支持进行定向诱变测试以确认其与脂蛋白的致敏能力的相关性的需要。
2024-01-11 17:37:42
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生物信息学
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