生物芯片高通量检测卵巢癌转录组差异表达基因的生物标记识别.pdf

FAANG_RNAseq:马FAANG的转录组学分析

转录组数据中差异基因的相关性分析

事实证明，下一代测序（NGS）是描绘多种癌症分子亚型的强大工具，并且可以揭示整个癌症进展过程中基因组突变的积累。 使用深度测序技术从喉鳞状细胞癌（LSCC）患者获得全基因组microRNA（miRNA）和mRNA表达谱，并通过综合计算方法进行分析。 大量蛋白质编码和非编码基因被检测到差异表达，表明LSCC细胞中的功能转换。 总共检测到127个突变基因与外胚层和表皮发育显着相关。 发现有11种miRNA差异表达，其中包括潜在的癌症抑制miRNA mir-34c，其表达明显下调。 对mRNA和miRNA转录组的综合分析进一步揭示了11个miRNA和138个靶向基因之间的相关动力学，从而形成了对LSCC发育的高度动态的共调节网络响应。