DeepVariant - Google开源深度学习模型，将基因组中的识别变异任务转换为图像分类问题的基因组学工具

基于变异粒子群的聚类挖掘.pdf

matlab有些代码不运行Geostats-matlab 该存储库包含用于地统计分析的一组功能和测试脚本，包括变异函数图绘制和分析，克里金法，随机场模拟和数据的条件模拟。 分析的主要功能是geostatm.m。 此函数接受协方差模型（可以是高斯，指数，球面，矩阵，块金或幂定律），以及初始参数猜测和要插值的数据。 该程序包仍在开发中，我主要只对2D数据集进行了测试，而对1D进行了一些有限的测试。 依存关系 variogramfit.m和randomfield.m是可与geostatm一起使用的两个可选函数。 randomfield是由Qiqi Wang（）和Paul G. Constantine（）开发的。 它用于生成具有给定协方差结构的随机字段，也可以用于条件仿真，尽管目前我不使用它们的代码来执行此操作。 Variogramfit是Wolfgang Schwanghart的lsqcurvefit的替代方法，我默认使用它来估计理论变异函数的参数。 以我的经验，lsqcurvefit通常效果更好，但根据情况的不同，差异可能很小。 这两个代码都可以从Matlab文件Exchange中获得。

variogramfit 执行各种理论变异函数与实验各向同性变异函数的最小二乘拟合。 用户可以在各种有界（例如球形）和无界（例如指数）模型之间进行选择。 也可以对金块方差进行建模，但不支持更高的嵌套模型。 该函数与 FEX 上可用的函数 fminsearchbnd 配合使用效果最佳。 您应该从文件交换下载它（文件 ID：#8277）。 如果您没有 fminsearchbnd，则 variogramfit 使用 fminsearch。 fminsearch 的问题在于，它可能会返回负方差或范围。 支持的有界模型： 'blinear' - 有界线性'circular'——圆形模型'sphereal' -- 球形模型，=默认值'pentaspherical' -- 五球面模型 支持的无界函数： '指数'-指数模型'gaussian' -- 高斯变异函数'whittle'-Whittle的基

variogram 计算各个维度的各向同性和各向异性实验变异函数。 句法： d = 变异函数(x,y) d = 变异函数(x,y,'pn','pv',...) 该函数使用 Malcolm wood 的 parseargs (objectId=10670) 作为子函数。 目前，该函数一步计算所有变异函数值。 虽然这对于小数据集（n<2000）来说很快，但由于内存限制，它可能会在大数据集上失败。 因此，对于大型数据集，您可能需要使用 'subsample' 选项。

针对Srinivas提出的自适应遗传算法种群前期进化较慢的问题，改进了自适应交叉率和变异率的计算方法，考虑交叉率和变异率与种群进化所处阶段的匹配，提出一种改进的自适应遗传算法；并将其应用于BP神经网络计算模型的优化，运用到汽车加油量计算中，通过比较标准BP网络、Srinivas提出的自适应遗传算法优化的BP神经网络和改进的自适应遗传算法优化的BP神经网络3种模型的计算误差，验证得出改进的自适应遗传算法优化BP神经网络的算法优于另外两种。

2021-孕妇外周血浆胎儿游离DNA高通量测序筛查致病性拷贝数变异的技术标准共识.pdf

matlab的egde源代码

2015-Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants.pdf

心率计算matlab代码心率变异性 单引线原始Zio贴片ECG信号的心率变异性测量 目录 用于HRV分析的R-peak和窦信号检测：R_peak_detector代码 从R_peak_detector文件夹运行Main.m文件以计算r-peak，并选择一个3分钟的正弦信号。 利用改进的pan-tompkins，主成分分析和抛物线拟合算法进行r-peak检测。 如果RR间隔的持续时间在上一个RR间隔的持续时间的15％以内，则将RR间隔视为窦性 HRV分析：HRV_完整代码 在运行R峰检测代码之后，在数据上运行HRV_full文件夹中的Main.m文件。代码将计算心率和HRV参数（RMSSD，LF，HF，LF / HF，SD1，SD2，SD1 / SD2，样本熵，仁义熵） 测试文件：130812_Z320892913_1563 来自单线索ZioPatch的9个小时的原始数据 PACE研究参与者的完全脱识别数据集：PACE脱识别ECGpatch HRV数据集28pts.xls 作者 HRV指数测量代码V.1 Muammar Kabir，博士，Nichole Rogovoy，BS Erick