内容概要：本文档是生信帮提供的Hi-C互作分析培训资料，详细介绍了Hi-C数据分析的全流程，包括质控、AB鉴定、TAD鉴定和Loop鉴定。Hi-C质控部分主要描述了HiC-Pro工具的使用，涵盖从测序数据（FASTQ文件）到交互矩阵的生成过程，包括两步对齐策略、数据过滤和有效对保存。AB鉴定部分介绍了通过计算Hi-C矩阵的PCA特征向量来识别A/B区室的方法。TAD鉴定部分描述了使用TAD-separation score度量来确定TAD边界，并生成多个输出文件以供后续分析。Loop鉴定部分则介绍了如何将原始矩阵转换为校正矩阵，并使用hicDetectLoops工具进行loop检测。
适合人群：具备生物信息学基础知识，特别是对基因组三维结构研究感兴趣的科研人员和研究生。
使用场景及目标：①掌握Hi-C数据分析的基本流程，包括数据预处理、质控和下游分析；②学会使用HiC-Pro、hicPCA、hicFindTADs和hicDetectLoops等工具进行具体操作；③理解Hi-C数据分析中的关键概念和技术细节，如有效对筛选、PCA特征向量计算、TAD分离得分和loop检测。
阅读建议：此资源详细介绍了Hi-C数据分析的具体步骤和工具使用方法，建议读者在学习过程中结合实际数据进行练习，并仔细阅读每个工具的参数说明，确保理解各个步骤的意义和作用。同时，建议读者关注数据质量控制，合理设置参数以提高分析结果的可靠性。
2026-04-03 16:53:47
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本指南是国家癌症中心国内首部针对开展肿瘤放射治疗的医疗单位加速器质控文件，对国内基层单位的物理师和医师的日常加速器质控与维修工作有指导作用。
2022-05-24 17:20:40
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AAPM TG18测试图是PACS图像质量控制的检测标准，即将发表的中国PACS标准明确要求采用AAPM TG18测试图进行图像质量检测
由于该组图像较多，只好分开上传了，望您耐心逐一下载了
2022-04-08 09:42:26
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